Constrained evolution of a core winter proteome across independently cold-adapted PACMAD grasses
本論文は、PACMAD 亜科のイネ科植物が独立して寒冷環境に適応する過程において、転写レベルではなくタンパク質レベルの応答が強く保存されており、特に LEA3 タンパク質の構造的保存が凍結耐性の鍵となることを示しています。
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evolutionary biology
261 件の論文
進化生物学は、生命がどのように時間とともに変化し、多様な姿を形成してきたかを解き明かす分野です。遺伝子の働きから種間の関係まで、過去の証拠と現在の観察を結びつけることで、私たちの存在のルーツに迫ります。
Gist.Science は、bioRxiv から投稿される進化生物学の新しいプレプリントをすべて収集し、専門用語を噛み砕いた解説と、技術的な詳細をまとめた要約の両方をご用意しています。これにより、専門家だけでなく広く一般の方々が、最先端の研究成果をスムーズに理解できます。
以下に、進化生物学の最新プレプリントの一覧をご紹介します。
Dental calculus as a record of Pleistocene reindeer oral, digestive and dietary flora
この論文は、フランスの更新世のトナカイの歯石から古代メタゲノム解析を行い、口腔・消化管微生物叢と食性の遺伝的連続性と変遷を解明し、歯石が絶滅種を含む過去の生態系を復元する強力な手段であることを示したものである。
Phylogenetic estimation of diversity-dependent biogeographic rates using deep learning
この論文では、深層学習を用いて種多様性に依存した生物地理学的分岐率を推定する新しいモデル「DDGeoSSE」を提案し、カリブ海のアノリトカゲと雲霧林のビブルナム属植物の事例を通じて、局所的な種多様性が分岐動態を形成する上で重要な役割を果たしていることを実証しています。
The effect of age and sex on the rate of de novo mutations in barn owls
この研究は、33 組の親子対を用いた解析により、フクロウにおいて父親が母親の 2 倍の突然変異を子に伝え、かつ父親の年齢が高いほど変異数が増加することを明らかにし、鳥類における生殖細胞の老化と性差・年齢による突然変異率の影響を実証した。
Summary statistics and approximate bayesian computation are comparable to convolutional neural networks for inferring times to fixation
約 20 万回のシミュレーションに基づき、生データから直接学習する機械学習モデル（畳み込みニューラルネットワークなど）は、従来の要約統計量を用いた手法と同程度に硬い選択的スウィープの固定時間を推定できることが示され、単一集団の単一時点の遺伝子型データには、固定時間とスウィープ開始時間をより明確に区別できる未発見のシグナルはほとんど残っていないと結論付けられています。
TriMouNet: An Algorithm for Inferring Level-1 Phylogenetic Networks from Multi-Locus Gene Tree Distributions.
本論文は、多遺伝子座データから統計的サポートを伴う最適なトリネットを推定し、それらを統合して種系統ネットワークを構築する新しいアルゴリズム「TriMouNet」を提案し、シミュレーションおよび実データを用いた実験により、従来の連結法よりも低い偽陽性率で交配事象を特定できることを示しています。
Making friends in an asymmetric game: the establishment of male-female grooming exchanges in vervet monkeys
この研究は、野生のキツネザル（ベレットモンキー）における異性間のグルーミング交換が、理論的な「段階的投資」や「全額投資」戦略の単純な適用ではなく、メスが初期に高い投資を行い徐々に調整する一方、オスが居住年数に応じて頻度を高めるという、性差と生活史パラメータに依存した複雑な協力関係の確立過程を示している。
Conservation and divergence of sex-biased gene expression across 50 million years of Drosophila evolution
本論文は、5000 万年にわたるショウジョウバエの進化において、頭部と体で性バイアス発現の保存性と入れ替わりのパターンが異なり、多くの種特異的な性バイアスの獲得が両性の協調的な発現変化を通じて生じ、正の選択の影響を受けていることを明らかにした。
Life-stage-specific specialities in the cell atlases of the Clytia hemisphaerica planula and medusa
本研究は、単細胞トランスクリプトミクスを用いてクラゲ（Clytia hemisphaerica）の幼生期（プラヌラ）と成体期（メデューサ）の細胞アトラスを比較し、両者が広範な細胞カテゴリーを共有しつつも、それぞれの生活段階に特化した細胞タイプや転写プロファイルの差異が存在することを明らかにしたものである。
Mutational divergence over years in local populations of the selfing nematode Caenorhabditis elegans
フランスの自然環境から採取された線虫 C. elegans の全ゲノム配列を 2009 年から 2022 年にかけて解析した本研究は、突然変異の蓄積パターンから年次置換率や世代数を推定し、100 メートルスケールでの限定的な分散と時空間的な集団構造を明らかにした。